小さい＋器官を持つしくみ → 小さな生命体 → 微生物
organism の中心にあるのは、ギリシャ語の organon です。元の意味は「仕事をするための道具」でした。そこから、楽器のことも、体の中で働く器官のこともそう呼ぶようになります。教会のパイプオルガン organ も、内臓の organ も、同じ語です。organism は、器官が組み合わさって働く「しくみを持った生きもの」を指します。19世紀の後半、顕微鏡でしか見えない生物の研究が進むと、これに micro- を付けた microorganism が使われ始めました。
（語源の出典・確認先：Online Etymology Dictionary ／ Merriam-Webster ／ Wiktionary 参考文献の一覧）
よく使う形：harmful microorganisms(有害な微生物)
マイクロ＋オーガニズム（生物）＝目に見えない小さな生物。
学術的で、細菌・カビ・酵母などをまとめて指す。英国では micro-organism とハイフンを入れることも多い。
受験ミニ情報 長文で microbe・bacteria・germ と言い換えられることが多い。アクセントは or の位置（micro-OR-ganism）。
言い換え（同じような意味）
microorganism と同じ語源の単語です。パーツの意味から推理してみましょう。
micro(小さい)+organ(道具・器官)+ism(しくみ)→小さな生命体→微生物 organism の中心にあるのは、ギリシャ語の organon です。元の意味は「仕事をするための道具」でした。
微生物（名詞）。コアイメージは「顕微鏡でしか見えない生物」です。
マイクロ＋オーガニズム（生物）＝目に見えない小さな生物。 同じ語源の organ・organize・organic とまとめて覚えると効率的です。
/ˌmaɪkroʊˈɔːrɡənɪzəm/（マイクロウオーガニズム）。このページの「発音」ボタンで音声を聞けます。
