wholly の語源ストーリー
whole の頭の w は、発音されない文字です。古英語では hal と書き、w はありませんでした。15世紀ごろ、方言の発音の影響などで wh- のつづりが広まったとされます。ところが標準の発音には w の音が入りませんでした。そのため wholly は holy(神聖な)とほぼ同じ音になります。実は holy も、古英語 halig「傷のない・完全な」から来た親戚です。「完全なもの」が「神聖なもの」と考えられたのです。
(語源の出典・確認先:Online Etymology Dictionary / Merriam-Webster / Wiktionary 参考文献の一覧)

