足もと＋しるし → ページ下の注 → 脚注・付け足しの事柄
foot には「足」のほかに「いちばん下の部分」の意味があります。the foot of the mountain（山のふもと）や、the foot of the page（ページの下）です。footnote は、ページの下に置く注を指して19世紀に広まった語です。脚注そのものはもっと古く、18世紀の歴史家ギボンの『ローマ帝国衰亡史』は、皮肉の効いた脚注で有名です。今では a footnote in history（歴史の小さな付け足し）のように「重要でない出来事」の意味でも使われます。
（語源の出典・確認先：Online Etymology Dictionary ／ Merriam-Webster ／ Wiktionary 参考文献の一覧）
よく使う形：a footnote in history（歴史の小さな一コマ）
ページの foot（足もと）に付ける note（注）＝脚注。
論文の脚注のほか、a mere footnote（取るに足らない事柄）の比喩でもよく使う。
受験ミニ情報 アクセントは第1音節 FOOT-note。巻末の注は endnote。評論の a footnote to history の比喩に注意。
言い換え（同じような意味）
footnote と同じ語源の単語です。パーツの意味から推理してみましょう。
foot(足・下の部分)+note(注)→ページ下の注 foot には「足」のほかに「いちばん下の部分」の意味があります。the foot of the mountain（山のふもと）や、the foot of the page（ページの下）です。
脚注; 付け足し、取るに足らない事柄（名詞）。コアイメージは「ページの足もとに書く注」です。
ページの foot（足もと）に付ける note（注）＝脚注。 同じ語源の footprint・foothold・pedestrian とまとめて覚えると効率的です。
/ˈfʊtnoʊt/（フットノート）。このページの「発音」ボタンで音声を聞けます。