10番目＋する → 10人に1人を罰する → 壊滅させる
decimate の decim は「10番目」です。ローマ軍には decimatio という罰がありました。反乱や敵前逃亡をした部隊の兵を10人ずつに分けます。そしてくじで1人を選び、残りの仲間に処刑させたのです。つまり元は「10人に1人を殺す」という意味でした。英語にこの語が入ったのは16世紀末です。17世紀には「多くを殺す・大打撃を与える」の意味でも使われるようになりました。今は「壊滅させる・激減させる」の意味がふつうです。
（語源の出典・確認先：Online Etymology Dictionary ／ Merriam-Webster ／ Wiktionary 参考文献の一覧）
よく使う形：decimate a population(個体数を激減させる)
デシ(deci=10分の1)から転じて大打撃を与える
decimate は「（人口・動植物・組織を）激減させる」。受け身 be decimated by disease（病気で激減する）の形が多い。
受験ミニ情報 アクセントは第1音節 DEC-i-mate。難関私大の語彙問題で devastate と言い換えられる。
言い換え（同じような意味）
decimate と同じ語源の単語です。パーツの意味から推理してみましょう。
decim(10番目の ← decem 十)+ ate → 元々は10人に1人を処罰する意味から転じて壊滅させる decimate の decim は「10番目」です。ローマ軍には decimatio という罰がありました。
大量に破壊する、壊滅させる（動詞）。コアイメージは「10人に1人を罰する」です。
デシ(deci=10分の1)から転じて大打撃を与える 同じ語源の decimal・December・dime とまとめて覚えると効率的です。
/ˈdesɪmeɪt/（デシメイト）。このページの「発音」ボタンで音声を聞けます。
